أُحدث قسم الأمراض الباطنة عام 1979م.

ويتحمل القسم مسؤولية أكاديمية كبيرة، ويُعنى بتقديم مقررات دراسية تتعلق بالأمراض الباطنة لطلاب الطب البشري للمستويات الرابعة والخامسة والسادسة.