أُحدث هذا القسم عام 1395هـ لتدريس علم وظائف الأعضاء لطلاب الهندسة الطبية، والسنة الثانية تقنية طبية، والسنة الثانية طب أسنان، وطلاب السنتين الثانية والثالثة في كلية الطب.

وقام أعضاء هيئة التدريس في القسم بتدريس علم وظائف الأعضاء لطلاب السنة الثانية صيدلية بعد إحداث كلية الصيدلة من العام الدراسي 1423/ 1424هـ، إضافة إلى تدريس طلاب السنتين الثانية والثالثة في الطب الموازي الذي بدأ الانضمام إليه عام 1423/ 1424هـ.

وعمل القسم على تهيئة برنامج الدراسات العليا في علم وظائف الأعضاء منذ عام 1419هـ، ويتضمن التدريس لطلاب الدراسات العليا والإشراف على البحوث ورسائل الماجستير.

وقام أعضاء الهيئة التدريسية بالمساهمة في تدريس درجة الزمالة العربية والزمالة البريطانية لأمراض النساء والولادة، وطلاب الجزء الأول من درجة الزمالة الإيرلندية للجراحين.