​أُحدث المعهد الصحي للبنات بمحافظة ينبع عام 1426هـ الموافق 2/2 /1426 هـ بالقرار الإداري رقم (49/ 35/ش) بتاريخ 2/2/ 1426هـ، وجرى تعيين رمز المعهد (890) من قبل الإدارة العامة للمعاهد والكليات الصحية.

واُستهلت الدراسة في العام نفسه بقبول الدفعة الأولى من خريجات الثانوية العامة، حيث إنَّ مدَّة الدراسة سنتين (أربعة فصول دراسية) بتخصص تمريض عام، وفترة امتياز لمدَّة ستة شهور تتضمن تدريباً مكثفاً في مستشفيات المملكة العربية السعودية.

وصدر قرار المشرف العام على الإدارة العامة للمعاهد والكليات الصحية بالرياض رقم (990-35-م) بتاريخ 15 /9/ 1427هـ، بتحوِّيل المعهد الصحي للبنات بمحافظة ينبع إلى كلية صحية متوسطة، وكذلك تحوِّيل برنامج دبلوم التمريض العام إلى برنامج دبلوم الكليات الصحية، وبناءً على موافقة وزارة الصحة اعتباراً من العام الدراسي 1428-1429 هـ، وانتقلت الكلية إلى مقرها بتاريخ 22-12-1428 هـ، حيث جرى نقل تبعية الكليات والمعاهد الصحية بخطاب المقام السامي رقم (11032 – م ب) إلى وزارة التعليم، وتكون الدراسة فيها تبعاً لبرنامج الكلية الصحية في المبنى الجديد بحي العامودي من أجل استيعاب الأعداد الجديدة.

وتعوِّل الخطة الدراسية للكلية على سنة تمهيدية تتضمَّن برنامج موسعٍ للغة الإنجليزية، وبعض المواد الأخرى مثل: مادة التشريح و وظائف الأعضاء وأخلاقيات المهن الصحية، والتي تمكن الطالبة من فهم مواد مرحلة العلوم التمريضية الأساسية خلال السنتين القادمتين، يضاف إلى ذلك مرحلة امتياز مدَّتها ستة أشهر بأحد المستشفيات التعليمية في المحافظة.

وجاء التعاون مع القطاع الصحي بمحافظة ينبع بناءً على ميثاق سابق يتضمَّن تدريب الطالبات بالمستشفيات والمراكز الصحية بمحافظة ينبع بتاريخ 4/7/1430هـ، وصدر قرار مجلس التعليم العالي رقم (3 /١430 ) بإعادة هيكلة كلية العلوم الصحية بينبع الى كلية العلوم الطبية التطبيقية للبنات.