أُحدث قسم الرياضيات عام 1384/ 1385هـ، باعتباره التوأم المشابه لقسم الفيزياء، عندما صدرت أول لوائح كلية التربية شطر مكة المكرمة في جامعة الملك عبد العزيز، وتخرجت العديد من الدفعات وفق نظام الاختصاص المزدوج (فيزياء ورياضيات)، واعتباراً من هذا الدمج فقد كان الإشراف العلمي موحداً بين القسمين.

وواصل العمل بهذا النظام لفترة عشر سنوات، حتى انفصل قسم الرياضيات عام 1394/ 1395هـ، وأصبح قسماً مستقلاً بذاته، يقدِّم درجة البكالوريوس في الرياضيات والتربية، وفيما تولى إدارته قسم الرياضيات بكلية العلوم في جامعة الملك عبدالعزيز بجدة لمدة عام واحد.

كان القبول محصوراً بالطلاب فقط، ثم بدأ القسم باستقبال الطالبات عام 1394/1395هـ، وفي عام 1395/1396هـ اتصل القسم بكلية التربية في جامعة الملك عبدالعزيز بمكة المكرمة من حيث الوحدة العلمية والتنظيم الإداري.

وأُدخل نظام الساعات المعتمدة على شطر مكة المكرمة جامعة الملك عبد العزيز عام 1396/ 1397هـ، وصار القسم يقدِّم مقرراته تبعاً لنظام الساعات المعتمدة، ويوفر درجة البكالوريوس في الرياضيات.

وأُنشئت جامعة أم القرى بمكة المكرمة عام 1400/ 1401هـ، وما إن تأسست كلية العلوم التطبيقية حتى انضمَّ قسم الرياضيات إليها، ويقدِّم درجة البكالوريوس بالرياضيات البحتة أو الرياضيات مع التأهيل التربوي.

وفي عام 1403/ 1404هـ أطلق عليه اسم (قسم العلوم الرياضية) بهدف تحويل مختلف الاختصاصات الرياضية إلى شعب علمية مستقلة بذاتها مُدرجة تحت قسم واحد يشرف عليها، وتحقيق التواصل بين الاختصاصات المختلفة دون أن يسود تخصص على آخر.

ينال الطالب من خلال الدراسة بالكلية درجة البكالوريوس في العلوم الرياضية (40400) بعد النجاح في تجاوز (136) ساعة معتمدة، وتنقسم المقررات بين الرياضيات التطبيقية، الإحصاء والاحتمالات، الرياضيات البحتة.

وهذه طريقة متميزة من نمطها، فيها الكثير من المرونة للطالب، وتمنح الفرصة للتقدُّم بفعالية في المسارات الثلاثة، وتفتح مجالات متنوعة أمام الطالب، فإن أراد متابعة التحصيل العلمي فإنه يملك الأسس المتينة لمتابعة دراسته في أحد المسارات الثلاثة، أو يمكنه العمل في الوزارات والمؤسسات الخاصة والحكومية كالدوائر الإحصائية والبنوك وغيرها، وكذلك يمكن للخريج العمل في مجالات التدريس، حيث إنَّه يتميز بأريحية في المسارات الثلاثة بعد استيفاء بعض المقررات التربوية.

وإنَّ برنامج العلوم الرياضية يتوفر للطالبات والطلاب على السواء.