يعدُّ قسم علم الأدوية من الأقسام الأساسية في كلية الطب، وأُحدث بالتزامن مع تأسيس الكلية في جامعة الإمام محمد بن سعود الإسلامية.

يُعنى القسم بالمبادئ الأساسية للأساليب العلاجية التقليدية وغير التقليدية، حيث يجري تدريس الطلاب المبادئ الأساسية والتطبيقية لعلم الأدوية الإكلينيكي، وكيفية استعمالها لاستيعاب طرائق عمل الأدوية على مختلف أعضاء الجسم، والتأثيرات الجانبية لاستعمالها، ويتعرف الطلاب على أحدث الأدوية المستعملة لعلاج مجمل الأمراض مثل: أمراض الجهاز التنفسي والسكري وأمراض السرطان والأمراض العصبية والأوعية الدموية وأمراض القلب وغيرها من الأمراض التي تصيب أعضاء الجسم، والمبادئ العلمية للسلامة الدوائية، وأسس علم السموم وطب الأعشاب.

ويتعرف طلاب الكلية على المدارس الحديثة والقديمة في مجال الطب التكميلي والبديل، وأبرز ممارسات تلك المدارس كالإبر الصينية والحجامة والعلاج بالأعشاب، وأسلوب التعامل معها وزيادة وعي المجتمع اتجاه تلك الممارسات، علاوة على تدريس القسم معظم الموضوعات المرتبطة بعلم الأدوية لبقية مقررات الكلية.

يتضمن القسم العديد من أعضاء الهيئة التدريسية باختصاصات العلوم الصيدلانية الدقيقة، مما أدى إلى تميز القسم في مساهماته البحثية والمحكمة علمياً في الدوريات والمجلات العلمية، وانتساب الهيئات العلمية لمؤسسات الصحية ومراكز البحث الوطنية، وحظي أعضاء القسم بدعم مادي للبحوث من هيئات خارج وداخل جامعة الإمام محمد بن سعود الإسلامية.​