يعدُّ قسم الجراحة أنَّه أول قسم إكلينيكي تأسس بكلية الطب في الدمام عام 1975م.

وكانت تخصصات جراحة العظام، والعيون، والأنف والأذن والحنجرة، والتخدير، وجراحة المخ والأعصاب جزءاً من هذا القسم، وبعد ذلك تحولت إلى أقسام مستقلة.

يتألف القسم حالياً من تخصصات الجراحة العامة، وجراحة الأوعية الدموية، وجراحة الصدر والقلب، وجراحة التجميل، وجراحة الأطفال.