يعتبر قسم علم الأمراض (الباثولوجي) صلة وصل بين المرحلة الأكاديمية والسريرية، ومن خلال المقررات التي يقدمها القسم تبدأ معرفة الطالب بالأمراض وأسبابها وتشخيصها.

وتتضمن المقررات الدراسية للقسم دراسة شمولية لمجمل الأمراض، يتلو ذلك دراسة متخصصة لمجمل أعضاء الجسم، وأيضاً الطب الشرعي وأمراض الدم.