أُحدث قسم علوم وإدارة موارد المياه عام 1398هـ، كأحد الأقسام الأساسية الأربعة في كلية الأرصاد والبيئة وزارعة المناطق الجافة، ويُعنى بالدراسات المرتبطة بالمياه الجوفية والسطحية، وإدارة موارد المياه والري والصرف.