يُعنى قسم كيمياء النبات والنواتج الطبيعية في استكشاف المنتجات الدوائية الطبيعية المستخلصة من مصادرها الطبيعية كالكائنات الدقيقة والحيوانات والنباتات.

ويحرص القسم على تنقية وعزل المواد الفعَّالة من مصادرها الطبيعية، واستطلاع التأثير البيولوجي والكيميائي لتلك المواد، واستخداماتها الطبية، والتأثيرات الضارة الناجمة عن الاستخدام المغلوط لها.

إضافة الى عرض دور الأعشاب الطبية في برامج استكشاف الأدوية الجديدة، حتى يراعي القسم أحدث التطورات في مجالات طب الأعشاب وكيمياء النواتج الطبيعية وتطبيقاتها.