يسعى برنامج ماجستير الصيدلة الإكلينيكية المتطورة إلى تأهيل كوادر من الممارسين المتخصصين للعمل في مجال الصيدلة الإكلينيكية وصيدلية المستشفيات، ويعدُّ توليفة من المقررات التطبيقية والنظرية والوحدات البحثية، علاوة على الممارسة الإكلينيكية التي صُمِّمت لتقديم الخبرة والمعرفة في الممارسة الصيدلية المتطورة من خلال (57) وحدة دراسية.

تستوجب الدراسة في البرنامج أربعة فصول دراسية، حيث يكون البدء بعددٍ من المواد النظرية خلال الفصلين الأول والثاني، تُعنى بمقررات العلاجيات المتطورة وطرائق البحث والإحصاء للدراسات العليا، إضافةً إلى مجموعة من المواد الانتقائية عن اقتصاديات الدواء، والمعلوماتية الصحية، وإدارة الصيدلة في السنة الأولى.

تباشر الطالبة بعد ذلك بمتتالية من الدورات الإكلينيكية الاختصاصية لعام كامل، ضمن ما يقارب (9) دورات تزامناً مع إنجاز مشروع التخرج الذي يُقدَّم قبل نهاية الفصل الرابع كشرط أساسي للتخرج بإشراف عضو هيئة تدريس من الكلية.